Engagée depuis 2016 en faveur du sport féminin avec son programme « Sport pour Elles », FDJ a été pendant six éditions partenaire majeur de la Course By le Tour et est depuis 2021 partenaire du Paris-Roubaix Femmes.
Depuis 2022 et pour trois éditions, FDJ est devenu partenaire fondateur du « Tour de France Femmes avec Zwift ».
En 2022, FDJ a également créé avec la Fédération Française de Cyclisme le circuit de Coupe de France Elite Femmes FDJ devenu Coupe de France professionnelle Femmes FDJ, pour permettre à des cyclistes françaises de pouvoir se confronter à la concurrence internationale. Cet engagement en faveur du cyclisme féminin vise également l’accès à la pratique avec un dispositif « Vélo pour toutes ». Ce programme commun avec la FFC permet à des femmes d’apprendre à faire du vélo en sécurité en participant aux randonnées grand public sur les étapes du Tour de France Femmes avec Zwift.